El bicampeonato que logró con los Pumas de la UNAM, tras agenciarse el título en los torneos de Clausura y Apertura 2004, vino de la mano de su convocatoria para la Selección Mexicana, con Ricardo La Volpe en el timón.
Gonzalo Pineda fue puma por siempre, pues llegó a la organización unamita a los 13 años de edad. Militó en las divisiones menores hasta que el 17 de mayo de 2003 se produjo su debut en Primera División, ante Morelia.
El oriundo del Distrito Federal, en donde nació el 19 de octubre de 1982, formó parte de selecciones juveniles antes y después de su debut en el máximo circuito. Pineda fue integrante de la plantilla Sub-23 que participó en las Olimpiadas de Atenas 2004.Fue adquirido por las Chivas de Guadalajara para el Clausura 2006, y muy pronto consiguió su segundo gol en Primera División, ni más ni menos que para ganar un Clásico ante América.
Gonzalo Pineda Reyes siguió con su carrera ascendente en el club rojiblanco, en el que es titular indiscutible hasta la fecha.Sus actuaciones con Pumas le otorgaron un lugar en el Tricolor Mayor, con el que debutó el 8 de septiembre de 2004, frente a Trinidad y Tobago.La Volpe se terminó de convencer con el rendimiento de Pineda en las Chivas para incluirlo en la lista definitiva rumbo a la Copa del Mundo de Alemania ?06.
En la justa europea fue titular en los tres partidos de la primera fase, aunque sólo completó el primero contra Irán.Ante Argentina, en Octavos de Final, participó como relevo desde el minuto 66, y puede decirse que el "pecado" que cometió fue haberle dado libertades a Maxi Rodríguez para soltar el majestuoso disparo que significó la victoria pampera y la eliminación de México.
