El técnico ya no era el mismo, pues Manuel Lapuente había suplido en el timón a Bora Milutinovic, pero el objetivo no variaba: terminar entre los cuatro mejores, y ¿por qué no?, conseguir el campeonato.
En Paraguay '99 se repitió la historia. De nuevo apareció el desequilibrante Luis Hernández, quien había sido uno de los máximos anotadores en la Copa del Mundo celebrada un año atrás y el mejor artillero en Bolivia '97.Hernández logró tres dianas en Paraguay ?99, dos de ellas en el empate parcial de 3-3 ante Perú en los Cuartos de Final.
El segundo mejor artillero azteca en el certamen fue Cuauhtémoc Blanco, quien se despachó con dos goles, ambos en el partido ante Venezuela.Con ambas aportaciones y en general con un sólido accionar tricolor, se avanzó a la segunda ronda, tras derrotar 1-0 a Chile y 3-1 a Venezuela, pese a caer frente al futuro campeón, Brasil, por 2-1.
En los Cuartos de Final se volvió a dar el choque entre México y Perú, tal y como sucedió en Ecuador '93, y el resultado fue también a favor de los aztecas, en serie de penalties, por 7-5 global, sin embargo, el Tricolor se topó de nuevo -ahora en las Semifinales- con Brasil, quien tenía en sus filas a la tripleta ofensiva integrada por Ronaldo, Rivaldo y Marcio Amoroso. La combinación verde-amarelha fue más intensa, para que el Scratch du Oro accediera a la Final con un categórico 2-0.
El tercer lugar estaba a la vista. Chile fue el rival y la Selección Mexicana, con la inspiración de Francisco Palencia y Miguel Zepeda, lo atrapó al son de 2-1, para seguir con buena estrella en la justa continental, a la que asistía por cuarta ocasión consecutiva.
